“職業(yè)病診斷”是省級以上人民政府衛(wèi)生行政部門批準(zhǔn)獲得職業(yè)病診斷行政許可的醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)對勞動(dòng)者的病理改變是否與其職業(yè)環(huán)境有關(guān)作出的事實(shí)認(rèn)定。“臨床疾病診斷”是合法的醫(yī)療機(jī)構(gòu)根據(jù)其診療科目對患者的臨床癥狀及病理改變和治療建議作出的事實(shí)認(rèn)定。概括起來講，兩者存在著明顯的區(qū)別。
    首先，法律依據(jù)不同。職業(yè)病診斷是根據(jù)《職業(yè)病防治法》的規(guī)定，勞動(dòng)者可以在用人單位所在地或者本人居住地依法承擔(dān)職業(yè)病診斷的醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)進(jìn)行職業(yè)病診斷。臨床疾病診斷是醫(yī)師根據(jù)《執(zhí)業(yè)醫(yī)師法》，在執(zhí)業(yè)活動(dòng)中享有基本的診斷治療權(quán)。執(zhí)業(yè)醫(yī)師在注冊的執(zhí)業(yè)范圍內(nèi)，進(jìn)行醫(yī)學(xué)診查、疾病調(diào)查、醫(yī)學(xué)處置、出具相應(yīng)的醫(yī)學(xué)證明文件以及選擇合理的治療方案等，都是符合法律規(guī)定的。
    其次，診斷目的不同。職業(yè)病診斷是為了確定勞動(dòng)者的疾病病理改變是否與職業(yè)環(huán)境有法律上的因果關(guān)系，從而為后期行政認(rèn)定、行政處罰提供專業(yè)證據(jù)。臨床疾病診斷是通過各種檢查，使用藥物、器械及手術(shù)等方法，消除疾病或緩解病情，幫助患者恢復(fù)健康。
    第三，法律屬性不同。職業(yè)病診斷是衛(wèi)生行政機(jī)關(guān)針對專業(yè)醫(yī)學(xué)問題委托法定機(jī)構(gòu)進(jìn)行的一種行政鑒定。而醫(yī)學(xué)專家作出的臨床疾病診斷，法律屬性屬于專家意見范疇，絕非行政鑒定。
    第四，承擔(dān)機(jī)構(gòu)與法律責(zé)任不同。職業(yè)病診斷必須由省級以上人民政府衛(wèi)生行政部門批準(zhǔn)的醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)承擔(dān)。臨床疾病診斷須由衛(wèi)生行政部門批準(zhǔn)的醫(yī)療機(jī)構(gòu)和具有合法職業(yè)范圍的執(zhí)業(yè)醫(yī)師承擔(dān)。如對未取得執(zhí)業(yè)衛(wèi)生技術(shù)服務(wù)資質(zhì)認(rèn)證擅自從事職業(yè)病診斷的，行政部門可根據(jù)《職業(yè)病防治法》第七十二條的規(guī)定，責(zé)令其立即停止違法行為，沒收違法所得并處相應(yīng)的罰款。情節(jié)嚴(yán)重者還可以依法對其給予降級、撤職或者開除的處分。